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Briefings in Bioinformatics|张子丁课题组对人-病毒蛋白互作计算研究的现状和未来发展前景综述
发布日期:2021-04-08 浏览次数:  信息来源:澳门永利贵宾厅app下载


人与病毒之间的蛋白相互作用(PPI)介导了病毒感染和宿主免疫反应过程。因此,研究人-病毒PPI有助于了解人与病毒之间的复杂关系,并破译病毒感染的致病机制,从而可以指导开发防御或治疗病毒感染的策略。得益于高通量实验技术的发展,人-病毒PPI数据得到快速积累,这为围绕人-病毒PPI开展生物信息学研究提供了前所未有的机会。近日,澳门永利app下载地址张子丁教授课题组在Briefings in Bioinformatics上发表了题为Current status and future perspectives of computational studies on human–virus protein–protein interactions的综述文章,对目前人-病毒蛋白互作计算研究领域的研究进展进行了总结,并对未来该领域的研究前景进行了展望。

    作者首先简要介绍了人-病毒PPI的实验鉴定方法和现有的存储人-病毒PPI的重要数据库资源。然后重点讨论了人-病毒PPI计算预测方法的开发研究进展,特别是对基于机器学习的预测方法进行详细阐述,并强调了在未来需要将最新的深度学习算法和新的特征工程技术(例如源自自然语言处理的蛋白嵌入式编码)充分运用于人-病毒PPI预测中。为了进一步增进对人-病毒PPI研究的理解,作者还概述了人-病毒相互作用组的实际应用, 包括基于-病毒相互作用组的机制分析以及新的治疗策略的开发。最后,作者指出了该研究领域的未来发展趋势,为将来的研究人员提供了更多的提示。

  澳门永利app下载地址的博士生连娴奕为该论文的第一作者,张子丁教授和植物生理生化国家重点实验室的杨世平博士为该论文的共同通讯作者。另外该研究得到了国家重点研发项目2017YFC1200205的经费支持。

 

 

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